18. in 19. junija je francoska flota zapustila Malto in se preselila na obalo Severne Afrike. Na krovu vodilne ladje je bilo življenje v polnem teku: poveljnik odprave je kot običajno delal od zgodnjega jutra. Za kosilo so se v njegovi kabini zbrali znanstveniki, raziskovalci, častniki. Po kosilu so potekale živahne razprave in razprave. Teme je Napoleon skoraj vedno predlagal: to so bila vprašanja vere, politične strukture, strukture planeta itd. 30. junija so se pojavile obale Afrike. 2. julija je bila pri Marabuju pri Aleksandriji vojska na hitro, a v popolnem redu, iztovorjena. Nemudoma so se vojaki odpravili in nekaj ur kasneje so bili pri Aleksandriji. Francozi so vstopili v mesto. Francoska flota pod poveljstvom admirala Bruycea d'Egalierja je ostala v bližini Aleksandrije, potem ko je prejela ukaz vrhovnega poveljnika, naj najde prehod dovolj globoko, da bojne ladje vstopijo v mestno pristanišče, kjer bodo varne pred možnim napad britanske flote.
Najnevarnejši del pohoda je dolga pot čez morje, ki je ostala za seboj. Več kot štirideset dni je bila francoska armada na morju, prehajala je od zahoda proti vzhodu in od severa proti jugu, vendar nikoli ni srečala Britancev. Na kopnem se Napoleon in njegovi vojaki niso ničesar bali, počutili so se kot vojska zmagovalcev. Kje so bili Britanci? Je bil "zahrbtni Albin" prevaran s precej preprostimi dezinformacijami, ki so jih uporabljali francoska vlada in njeni zastopniki?
Pravzaprav je francosko floto rešila veriga nesreč. Napoleon se je res rodil pod srečno zvezdo. Nelsonu so poslali močno okrepitev 11 ladij linije (pod njegovim poveljstvom je bil oddelek 3 ladij linije, 2 fregati in 1 korveto) in ukaz admirala Jervisa, naj sledi Francozom povsod v Sredozemlju in celo v Črno morje.
17. maja je bil Nelson že blizu Toulona in je izvedel za sestavo francoske flote. Toda na dan, ko je francoska flota zapustila, je izbruhnil silovit vihar, Nelsonove ladje, vključno z vodilno ladjo, so bile močno uničene, zaradi česar se je admiral umaknil na Sardinijo. Britanske fregate, ki so izgubile vodstvo, so se odločile, da ga je velika škoda prisilila, da poišče zatočišče v nekem angleškem pristanišču, so ustavile izvidovanje in ga odšle iskat. Francoska flotila je 19. maja odšla in se ob ugodnem vetru približala Korziki, kjer sta bili na ladje postavljeni 2 pol brigadi generala Vauboisa.
Nelson je nekaj dni popravljal škodo in se 31. maja približal Toulonu, kjer je izvedel za odhod francoske odprave. Toda britansko poveljstvo, ki je izgubilo fregate, ni moglo zbrati nobenih podatkov niti o smeri, kamor je šel sovražnik. Poleg tega je prišlo do zatišja, Nelson je izgubil še nekaj dni. 5. junija je Nelsonov odred našel izvidniško brigado, ki jo je poslal kapetan Trowbridge, ki je vodil eskadrilje ladij linije, 11. junija pa je bil admiral že na čelu močne flote 14 ladij linije. V upanju, da bo našel sovražnikovo floto, je Nelson sestavil načrt napada: dve 2 diviziji po 5 ladij linije naj bi napadli sile francoskega admirala Bruycea (13 ladij linije, 6 fregat), tretja divizija 4 ladje, pod poveljstvom Trowbridgea, naj bi uničile transporte.
Nelson, ki ni poznal smeri gibanja francoske flote, je iskal italijansko obalo. Obiskal je otok Elba, 17. junija se je približal Neaplju, kjer je angleški odposlanec Hamilton predlagal, da bi Napoleon lahko odšel na Malto.20. junija je britanska flota prečkala Messinsko ožino, kjer je Nelson izvedel za Napoleonov zavzetje Malte. 21. junija je bil Nelson le 22 milj od francoske flote, vendar zanj ni vedel in je hodil proti jugozahodu. Napoleon je še naprej vozil. 22. junija je Nelson iz mimoidočega trgovskega plovila izvedel, da je sovražnik že zapustil Malto in se odpravlja proti vzhodu. To je admiralu potrdilo idejo, da gre sovražnik v Egipt. Nelson je hitel v zasledovanje, saj je hotel prehiteti in uničiti sovražnika.
Usoda odprave v Egipt je visela na nitki, toda francoskemu poveljniku je spet priskočila na pomoč sreča. Nelson je imel le vojne ladje in je s takšno hitrostjo dirkal po morju, da je prehitel precej počasnejšo francosko armado severno od Krete. Poleg tega Nelson ni imel fregat in ni mogel izvesti popolnega izvidništva. 24. junija je Nelson prehitel francosko floto in se 28. junija približal Aleksandriji, a je bila racija prazna, tukaj nihče ni vedel za Francoze in ni pričakoval njihovega nastopa. Nelson je verjel, da so Francozi, medtem ko je bil tik ob obali Afrike, vdrli na Sicilijo, mu zaupali zaščito ali se odpravili proti Carigradu. Britanska eskadrila je spet hitela na cesto, Francozi pa so 2. julija izkrcali čete v bližini Aleksandrije. Francozi se bitki na morju niso mogli izogniti, ampak so le odložili njen začetek. Bilo je jasno, da se bodo Britanci kmalu vrnili.
Napoleon v Egiptu
Egipt je bil takrat de jure v lasti osmanskih sultanov, v resnici pa jih je stopil vojaški kastni razred Mamelukov, Mamelukov (arabsko - "beli sužnji, sužnji"). To so bili turški in kavkaški bojevniki izvora, ki so tvorili stražo zadnjih egipčanskih vladarjev iz dinastije Ayyubid (1171-1250). Število te konjeniške straže se je v različnih časih gibalo od 9 do 24 tisoč konjenikov. Leta 1250 so mameluki strmoglavili zadnjega ayyubidskega sultana Turan Shaha in prevzeli oblast v državi. Mameluki so obvladovali najboljše dežele, glavne vladne urade in vsa donosna podjetja. Mameluški begovi so se osmanskemu sultanu poklonili, priznali njegovo nadvlado, vendar praktično niso bili odvisni od Konstantinopla. Arabci, glavno prebivalstvo Egipta, so se ukvarjali s trgovino (med njimi so bili veliki trgovci, povezani z mednarodno trgovino), obrtjo, kmetijstvom, servisiranjem prikolic itd. Najbolj zatirana in najnižja družbena skupina so bili Kopti-kristjani, ostanki predarabskega prebivalstva v regiji.
Bonaparte je po manjšem spopadu zavzel Aleksandrijo, to obsežno in nato precej bogato mesto. Tu se je pretvarjal, da se ne bori z Osmanlijami, nasprotno, imel je globok mir in prijateljstvo s Turčijo, Francozi pa so prišli osvoboditi lokalno prebivalstvo pred zatiranjem Mamelukov. Bonaparte je že 2. julija s pritožbo nagovoril egipčansko ljudstvo. V njem je dejal, da begovi, ki vladajo Egiptu, žalijo francoski narod in ga podrejajo trgovcem in prišla je ura maščevanja. Obljubil je, da bo kaznoval "uzurpatorje" in dejal, da spoštuje Boga, njegove preroke in Koran. Francoski poveljnik je Egipčane pozval, naj zaupajo Francozom, naj se združijo z njimi, da bi odvrnili jarem Mamelukov in ustvarili nov, bolj pravičen red.
Napoleonova zgodnja dejanja so pokazala, kako skrbno je premišljeval vojaške in politične podrobnosti egiptovske operacije. Ta racionalnost in učinkovitost sta zaznamovali tudi številna prihodnja dejanja Napoleona in njegovih sodelavcev v Egiptu. Toda Napoleon, ki se je pripravljal na pohod v Egipt, se je resno napačno izračunal na področju psihologije lokalnega prebivalstva. Tako kot v Italiji je tudi v Egiptu upal, da bo našel množice prikrajšanega, zatiranega in nezadovoljnega prebivalstva, ki bo postalo njegova družbena podlaga za osvajanje in obdržavanje regije. Vendar se je Napoleon napačno izračunal. Prisotno in obubožano prebivalstvo je bilo prisotno, vendar je bilo na tako nizki stopnji razvoja, da ni bilo pomembno, kdo dominira v državi - Mameluki, Osmanlije ali Evropejci. Vprašanje je bilo v vojaški moči novih osvajalcev in zmožnosti zadrževanja zajetega ozemlja. Vsi pozivi k boju proti fevdalcem-begovom preprosto niso prišli v zavest prebivalstva, felahi jih še niso mogli zaznati.
Posledično se je Napoleon v Egiptu znašel brez socialne podpore, kar je na koncu uničilo vse načrte francoskega poveljnika. Njegovi strateški načrti vključujejo 35 tisoč. francoska vojska naj bi postala jedro, predpogoj velike osvobodilne vojske, v katero bi se pridružili prebivalci Egipta, Sirije, Perzije, Indije in Balkana. Veliki pohod na vzhod naj bi privedel do razpada Otomanskega cesarstva in vpliva Britancev v regiji. V Egiptu je bilo prebivalstvo do njegovih klicev ravnodušno. Reforme protifeudalnega reda mu niso dale podpore lokalnega prebivalstva. Ozko-vojaška narava operacije ni mogla voditi do uresničevanja velikih načrtov za preobrazbo Vzhoda, ki si jih je zamislil Napoleon. Napoleonova vojska bi lahko premagala sovražnika in zavzela pomembna ozemlja, vendar je bila težava v ohranjanju osvojenega. Francozi so bili odstranjeni iz svojih baz in pod prevlado britanske flote na morju so bili slej ko prej obsojeni na poraz.
Antoine-Jean Gros. "Bitka pri piramidah" (1810).
V Kairo
Bonaparte ni ostal v Aleksandriji; v mestu je ostalo močnih 10.000 mož. garnizon pod poveljstvom Kleberja. V noči na 4. julij se je francoska avantgarda (4600 divizij Deseta) podala v smer Kairo. Od dveh cest: skozi Rosetto in naprej po reki Nil ter skozi puščavo Damangur (Damakur), ki se je povezovala pri Romih, je francoski vrhovni poveljnik izbral zadnjo, krajšo pot. Za avangardo so bili oddelki Bon, Rainier in Mainu. Ta je prevzel poveljstvo nad okrožjem Rosetta, v sami Rosetti je ostalo 1000. garnizon. Hkrati je divizija generala Dugasa (nekdanji Kleber) šla skozi Aboukir v Rosetto, tako da je morala od tam slediti do Romagne v spremstvu flotile lahkih ladij, ki so nosile strelivo in hrano po Nilu. 9. julija je sam Bonaparte odšel iz Aleksandrije s sedežem. Pred tem je admiralu Bruesu, ki je šel v Abukir, ukazal, naj se tam ne zadržuje in se preseli na Krf ali vstopi v Aleksandrijsko pristanišče.
Prečkanje puščave je bilo zelo težko. Vojaki so trpeli zaradi žgočih žarkov afriškega sonca, težav pri prečkanju vročega puščavskega peska in pomanjkanja vode. Domačini, ki so bili obveščeni, da želijo nevernike spremeniti v sužnje, so zapustili svoje bedne vasi. Vodnjaki so bili pogosto poškodovani. Bič vojske je bila griža. Mameluki so s svojimi napadi občasno nadlegovali francosko vojsko. Napoleonu se je mudilo, vedel je, da je treba sovražnika premagati pred poplavo Nila, saj bo med poplavo celotno območje v Kairu močvirje, kar bo izjemno otežilo nalogo uničevanja glavnih sil sovražnik. Poveljnik je hotel v eni splošni bitki zlomiti sovražnikov odpor.
9. julija so Francozi prispeli v Damakuro in se naslednji dan odpravili na romsko. 13. julija so Francozi premagali Mameluke pri vasi Shebreis. Tu so francoski poveljniki uporabili formacijo na trgu proti pogumni sovražnikovi konjenici - vsaka divizija se je postavila v kvadrat, na bokih katerega je bilo topništvo, v notranjosti pa konjeniki in vozički. Mameluki so se umaknili v Kairo.
Bitka pri piramidah
Ko so bili minareti v Kairu že vidni v daljavi, pred francoskimi 20-hilj. vojska se je pojavila konjenica Mamelukov. 20. julija 1798 je francoska vojska prišla do vasi Vardan, tukaj je poveljnik četam dal dvodnevni počitek. Vojaki so potrebovali vsaj malo okrepčila in se spravili v red. Konec drugega dne so obveščevalne službe poročale, da se mameluška vojska pod poveljstvom Murad -bega in Ibrahim -bega pripravlja na boj v taborišču v bližini vasi Imbaba. Napoleon je začel pripravljati vojsko na splošno bitko. Francoske čete so po 12-urnem pohodu zagledale piramide.
Turško-egipčanska vojska Murada in Ibrahima je zasedla položaj, ki je ob desnem krilu mejil Nil, z levim pa piramide. Na desnem boku so utrjen položaj zasedli janičarji in pehotne milice s 40 topovi; v središču so bile najboljše egiptovske sile - konjeniški korpus Mamelukov, plemeniti Arabci, na levem boku - arabski beduini. Del turško-egipčanske vojske pod poveljstvom Ibrahima se je nahajal na vzhodnem bregu Nila. Reko je zaprlo približno 300 ladij. Za ogled bitke so se zbrali tudi prebivalci Kaira. Natančna velikost turško-egipčanske vojske ni znana. Kirheisen poroča o 6.000 mamelukih in 15.000 egiptovskih pehotah. Napoleon v svojih spominih govori o 50 tisoč hordah Turkov, Arabcev in Mamelukov. Poroča se tudi o številki 60 tisoč ljudi, med njimi 10 tisoč mameluških konjenikov in 20-24 tisoč janičarjev. Poleg tega je očitno, da je v bitki sodeloval le del turško-egipčanske vojske. Očitno je bila velikost Muradove vojske približno enaka francoski ali pa jo je nekoliko presegla. Velik del egipčanske vojske sploh ni sodeloval v bitki.
Pred bitko je Napoleon vojake nagovoril z govorom, v katerem je izrekel svojo znamenito frazo: "Vojaki, štiridesetstoletna zgodovina vas gleda!" Očitno je upanje na zgodnji počitek v Kairu igralo pomembno vlogo pri visoki morali vojakov. Vojska je bila razdeljena na 5 kvadratov. Napoleonov štab je opravil izvidovanje in hitro ugotovil slabosti sovražnika: glavni tabor Mamelukov pri Imbabi (Embaheh) je bil slabo utrjen, topništvo je stacioniralo, sovražnikova pehota ni mogla podpirati konjenice, zato Napoleon ni pripisoval velikega pomena sovražnikovi pehoti. Prva stvar, ki jo je bilo treba storiti, je bila zdrobiti konjenico Mameluke v sredini.
Okoli 15.30 je Murad beg sprožil obsežen konjeniški napad. Prednji oddelki Rainier in Dese sta bila obkrožena z množico sovražnikove konjenice, ki jo je vodil sam Murad Bey. Mamelukov je začel pokositi puško in topniški ogenj. Vztrajna francoska pehota ni povzročila panike in se ni ustrašila pred ostro sovražno konjenico. Tisti posamezni konjeniki, ki so se lahko prebili do trga, so umrli pod udarci bajonetov. En odred Mamelukov, ki je utrpel velike izgube, se je lahko prebil skozi obrambo Dezeja in vdrl na trg, vendar so ga hitro obkolili in ubili. Mameluki so nekaj časa krožili okoli nedostopnega trga, potem pa se niso mogli upreti uničujočemu ognju in se umaknili. Murad se je z delom odreda umaknil v piramide v Gizi, drugi Mameluki so odšli v utrjeno taborišče.
Hkrati so divizije Beaune, Dugua in Rampon odvrnile napad sovražne konjenice iz taborišča iz Imbabe. Konjica se je umaknila v Nil, v vodah katerega so mnogi našli smrt. Potem je bilo sovražno taborišče zavzeto. Egipčanska pehota iz taborišča v Imbabi, ki je spoznala, da je bitka izgubljena, je taborišče opustila in začela uporabljati improvizirana sredstva ter plavati na drugi breg Nila. Muradovi poskusi preboja v taborišče so bili zavrnjeni. Beduini, ki so stali na levem boku in praktično niso sodelovali v bitki, so izginili v puščavi. Proti noči se je umaknil tudi Murad, ki je ukazal sežiganje ladij na Nilu.
To je bila popolna zmaga. Po napoleonovih besedah je turško-egipčanska vojska izgubila do 10 tisoč ljudi (mnogi so se utopili pri poskusu pobega). Izgube francoske vojske so bile zanemarljive - ubitih je bilo 29 vojakov, 260 je bilo ranjenih. Muslimanska duhovščina je po zmagi Napoleona brez boja predala Kairo. 24. julija 1798 je Napoleon vstopil v egiptovsko prestolnico. Murad Bey od 3 hilj. odred se je umaknil v Zgornji Egipt, kjer se je še naprej boril s Francozi. Ibrahim se je s tisoč konjeniki umaknil v Sirijo.
